Что очень странно. Applocale - по сути эмулятор японского, тогда как полноценная локаль есть полноценная локаль. Единственное, что я могу придумать - это то, что новелла использует какие то особенности например русской локали наряду с японской и поэтому нуждается в обоих локалях. Т.е. это может скажем быть имя пользователя виндовс на русском языке (тогда если игра сохраняет какие то сейвы или настройки в папке My Documents, то путь к ней прописывается через имя юзера с русскими буквами), либо название одной из папок, где инсталлирована игра - опять же на русском/использует какие то редкие спецсимволы.
Поэтому можно попробовать переименовать папки/переинсталлировать игру в другое место с простыми именами - либо завести нового юзера с английским именем.